使用scanR高含量筛查站实现生物样品的全自动图像采集和数据分析。设计专门针对细胞周期、蛋白质定位、细胞内转运等具体需求的个性化检测。模块化硬件与包括转盘共聚焦、机器人装载、培养、全内反射荧光和漂白后的荧光恢复系统在内的一系列附加系统兼容。
用于生命科学的模块化高内涵筛选工作站
基于显微镜的scanR模块化成像平台通过深度学习技术,可对生物样品进行全自动图像采集和数据分析。
强大的数据可视化功能,支持交互式分析
scanR系统在数据分析和评估方面表现出色——无论是离线处理还是与数据采集同时进行。该系统利用人工智能(AI)和深度学习技术,无需用户干预即可检测细胞或细胞核等目标。其强大的细胞计量数据分析功能旨在满足分析大量细胞群的特定需求。
所有数据点、时间曲线、细胞图库和图像数据之间的双向链接,都有助于对样品(从单细胞到数百万个细胞群)进行全面评估。每个数据点都可以完全追溯到其原始图像,支持透明和可重复的分析。该系统可在几分钟内轻松建立可靠的定量检测方法。
用于高内涵筛选的快速、自动化工作流程
scanR筛选工作站将基于显微镜设置的模块化和灵活性与高内涵筛选所需的自动化、速度和数据通量相结合。该系统灵活的设计可满足现代细胞生物学、分子生物学、系统生物学和医学研究中的定量成像和图像分析的需求。
生物样品的全自动图像采集和数据分析
专为多孔板、载玻片和定制阵列样品而设计
强大的分析模块,用于生物功能检测
非常适合检测方法开发和高内涵筛选
适用于固定细胞和活细胞

人工智能辅助目标检测和图像增强
我们的TruAI技术具备先进的分析能力,有助于简化检测方法的开发。强大的深度学习技术大幅减少了光漂白,提高了采集速度、测量灵敏度和准确性,从而可实现更长时间的观察,同时减少了对细胞活性的影响。
TruAI分割网络可提供强大的分割和分类功能,即使在有伪影、强度波动或背景信号的复杂样品中也能可靠运行。TruAI增强网络还通过从噪声数据中生成清晰图像或去除失焦信号来提升图像质量。
满足多种检测方法的需要
scanR基于检测方法的分析具有可重复性和可靠性,且能轻松融入您的工作流程。可在采集过程中实时获得结果,可对检测方法进行定制,经过调整可适用于多种应用。
该系统在药物发现应用中表现出色,包括显示化合物在细胞水平上的生化影响,以及在基因表达水平上药物诱导的变化。该解决方案可测量细胞凋亡、微核或DNA断裂(彗星试验),并涵盖了广泛的筛选应用:
细胞计数
基因表达
细胞增殖
早幼粒细胞白血病(PML)体分析
细菌和病毒感染分析
细胞阵列筛选
蛋白质定位与共定位
活细胞分析,包括动力学分析和对所获响应曲线的门控
多色分析
罕见事件分析
自动化FISH分析
组织切片中的荧光分析
细胞迁移
T细胞侵袭
细胞活力
质量控制
灵活的模块化硬件
scanR筛选工作站将基于显微镜设置的模块化和灵活性与高内涵筛选需求的自动化、速度和数据通量相结合。scanR工作站采用模块化设计,非常适合标准化检测和检测方法的开发,经过调整,可适用于研发实验室应用或多用户环境。
应用的技术
门控和分类
成功应用于细胞计量领域的强大数据分析概念,经过调整后,可满足分析大型图像数据集的需求。
多维图像数据以二维散点图或一维直方图的形式显示,可以使用图形工具选择感兴趣的聚类数据群。
来自不同图表的门控可通过布尔运算符进行组合,以创建复杂的分类方案。

分层门控法可直观地选择数据群,数据群还可在图库中显示。
自学习显微镜
自学习显微镜为高内涵分析开辟了新天地。其应用范围包括以前无法实现的图像分割和分类任务、超低信号水平的定量分析、简化染色方案、无标记分析等等。

使用自学习显微镜生成AI(人工智能)模型,对具有挑战性的明场图像进行无标记分析的示例工作流程。在训练阶段对Hela细胞的细胞核进行GFP标记,向系统演示如何分析明场图像。

对不同信号水平的细胞核进行稳健分割,可大幅减少定量分析的光照强度。
快速入门
随附的预训练神经网络模型可让您快速开始使用人工智能。使用预训练模型,您可以在大多数标准条件下开始检测细胞核和细胞。即使是融合在一起的细胞和致密的细胞核,也能可靠地进行区分。
内置的控制和验证措施有助于确保人工智能分析结果的准确性和稳健性。

原始数据

标准阈值分割

TruAI实例分割
实例分割能可靠地分离因非常靠近而难以区分的目标,如菌落或组织中的细胞或细胞核。
目标检测和分析
强大的目标检测模块可以分割细胞核、细胞或其他结构。
可选择多种检测算法,并进行调整使其适应感兴趣的目标。
根据分割结果,可以从含有100多个目标参数的列表中选择要提取的特征。
便于进行各种细胞检测。
即时质量控制
图像和目标与其相关的数据点相互关联:
点击数据点,就会在显示窗口中加载相关图像,并突出显示相关目标。
点击图像显示窗口中的目标,就会突出显示散点图和直方图中的相关数据点。
可为选定或门控的数据群的所有图像创建一个图库视图,以便能够直接、直观地比较包含相关信息的较大的图像集。

结果显示在热图中,还可导出到表中。轻松显示完整孔板的概览图。
多层级采集
在初步预扫描后,scanR分析软件可以识别所有潜在的感兴趣目标。在自动化工作流程中,初次分析结果可用于在第二次有针对性的筛选中选择性地扫描感兴趣目标。
使用动力学模块测量动力学参数
按活细胞、细胞核和其他目标的时变特性进行分类。
基于随时间测量的值(如强度、面积、比率、形状因子等静态参数平均值)评估跟踪曲线。
评估和分析静态参数,如荧光标记的强度或比率、位置、大小或形状随时间的变化。
曲线被压缩为单个特征值(动力学参数)。
在1D或2D直方图中绘制动力学参数,并根据其特定的时变特性对数据群进行门控。
高端成像与高内涵分析相结合
在同一个系统上运行cellSens活细胞成像软件和scanR解决方案,就可以使用相同的设置同时进行筛选和高端成像。
采用2D和3D受限迭代反卷积算法,可为严苛的筛选应用获得高质量的图像细节。
快速且易于使用的算法旨在减少失焦模糊和背景噪声,以呈现关键的结构细节。
有助于需要高分辨率结构细节的深入分析。
灵活的模块选项
scanR解决方案不仅满足了全自动高内涵筛选系统对速度、耐久性和可靠性的特定要求,还具备非凡的灵活性和适应性以及很强的扩展能力。这些优点让scanR系统能够满足更多应用和预算的需求。向系统中添加具有以下功能的模块:
基于深度学习技术的自学习显微镜
测量动力学参数
高速3D反卷积
基于IX-ZDC的红外(IR)激光硬件自动对焦
等等

配备红外(IR)激光硬件自动对焦功能的TruFocus
增强型连续自动对焦(AF)模式可确保观察平面始终保持精准对焦,即使在添加试剂或室温变化时也不受影响。
scanR筛选系统 | 用于生命科学领域、基于显微镜的筛选系统平台 |
灵活变通:系统配置可以根据应用进行调整 | |
高性能和耐久性:集成式系统和实时同步性能不仅具有开放式平台的优势,还可以满足筛选应用对数据通量和可靠性的严苛要求 | |
显微镜机架 | IX85/IX83倒置显微镜,单层或双层 |
LED照明选项 | 配备六个独立LED通道的Lumencor SPECTRA X光引擎(支持2023年起的新版本) |
CoolLED pe400 max,带4个独立的LED通道 | |
CoolLED pe300 ultra,带3个独立的LED通道 | |
根据应用优化的带通滤波器 | |
LED或卤素灯 | |
透射光照明选项 | 透射、相衬和DIC选项 |
带快速透射快门的荧光和透射组合(Prior公司的HF202HT,带Proscan III控制器) | |
硬件控制,用于CSU系统中的激光同步 | 可控制National Instruments USB-6343的数字(8通道)和模拟(4通道)输出。 |
相机选项 | Hamamatsu ORCA-Flash 4.0 V3高灵敏度冷却sCMOS相机,配备18.8 mm的大尺寸传感器芯片 |
Hamamatsu ORCA-Flash 4.0 LT经济型sCMOS相机,配备18.8 mm的大尺寸传感器芯片 | |
Hamamatsu ORCA-Fusion sCMOS相机,配备21.2 mm的大尺寸传感器芯片 | |
Hamamatsu ORCA-Fusion BT超低噪声sCMOS相机,配备21.2 mm的大尺寸传感器芯片 | |
物镜选项(支持X Line物镜) | 适用于“薄”(0.1 mm–0.2 mm)基板、盖玻片和玻璃底板的物镜(2倍、4倍、10倍、20倍、40倍、60倍、100倍) |
适用于“厚”(约1 mm)基板、塑料底板和玻片的物镜(2倍、4倍、10倍、20倍、40倍、60倍、100倍) | |
适用于“薄”(0.1 mm–0.2 mm)基板、盖玻片和玻璃底板的相衬物镜(10倍、20倍、40倍) | |
适用于“厚”(约1 mm)基板、盖玻片和玻璃底板的相衬物镜(10倍、20倍、40倍) | |
滤光镜组 | 单波段滤光镜组(根据要求提供规格) |
多波段滤光镜组(根据要求提供规格) | |
scanR系统软件 | 2个独立的软件模块:ScanR采集软件和ScanR分析软件。 |
分析可与采集同时进行 | |
软件模块可以安装在相同或不同的工作站上(Windows 10或11,64位) | |
scanR采集软件 | 以工作流程为导向的配置和用户界面 |
可变、功能强大的软件自动对焦程序可与选配的红外激光硬件自动聚焦功能、2步粗调和细调自动对焦功能、基于目标的自动对焦功能或基于图像的自动对焦功能相结合 | |
灵活的孔板管理器,带有预定义规格(载玻片、多孔板)和编辑界面,可创建和编辑自定义规格(斑点阵列) | |
阴影校正,可补偿阴影并优化空间强度均匀性 | |
延时筛选、Z堆栈筛选、多色筛选(采集通道数量不限) | |
支持集成到自动化样品制备生产线,例如,用于液体处理的可编写脚本的界面 | |
scanR分析软件 | 可与采集同时执行 |
适合经典应用的检测模板(计数、细胞周期、单双标记表达、易位、斑点探测) | |
检测构建器,用于设计您自己的检测 | |
图像处理、目标和主体检测、参数提取和计算 | |
细胞计量数据的探索、分析、门控和分类 | |
强大、灵活的门控概念,包括细胞群分析 | |
数据点、目标和图像之间的直接关联 | |
计算机 | 成像计算机(全新一代PC),Windows 10或11,64位,配备NVIDEA GPU,用于快速AI图像处理 |
附加选项 | scanR AI深度学习解决方案:基于人工智能(AI)的细胞分割训练和应用 |
延时动力学分析模块:一种基于细胞动力学的细胞追踪和细胞计量分类的独特方法 | |
3D反卷积模块(支持GPU加速) | |
用于高速成像的快速发射滤光轮(Prior的HF110或HF108,带ProScan III控制器) | |
共聚焦选项:配备一个或两个相机(同时采集)的Yokogawa CSU-W1和CrestOptics X-Light | |
活细胞培养系统 | |
平板装载机器人:在一次扫描中可装载40块平板 | |
编码放大倍率转换器(IX3-CAS) | |
附加scanR分析工作站 | |
scanR分析查看器 | |
scanR分析软件的第二许可证 | |
二合一系统设置 | 可与cellSens活细胞成像软件结合使用,以充分发挥其多功能性。 |

